对于化学除磷，污水厂每年投加到厂内的所采购的化学药剂的成本；投加系统的购置，管理维护成本；以及一个隐形的成本，化学污泥产生所带来的后续的污泥处置成本。这三项成本成为各个污水厂需要进行核算的经济指标。运行成本的增加，对于很多处于维持运转的中小型污水厂是一个非常大的问题。而这个问题将很快显现出来，如何保证污水中总磷的去除以及运行成本的管控成为污水厂运行管理的下一个重大课题。这两个问题一个是大的环境层面，一个是小的污水厂层面，但是都是我们每个运行管理人员需要深入思考和认真解决的问题，这需要我们不仅仅满足于现状的达标运行，还要进行更深层次的学习和摸索，为这些问题的解决提出更为切合实际的运行管理方案。在MBR膜污染方面依然有许多科学和技术问题尚未得到解决。总体来看，膜污染物来源多(污水、生物大分子、微生物)、形成途径复杂(膜截留、生物生成、生物降解等)和膜污染控制方法不成熟、机理不明确是困扰MBR膜污染识别、表征及控制的关键。另外，过高的膜投资成本无疑会限制MBR在污(废)水处理领域的应用。研发高性能膜材料或采用低成本过滤介质有望降低膜的投资成本。然而，如何确保新型膜材料和低成本过滤介质的稳定运行值得探究。